如果被告人被判定犯有刑事犯罪，法院将依法进行判决，判处相应的刑罚。
当工程重大安全事故涉嫌构成犯罪时，可以按照以下步骤追究刑事责任：
1. 报案：事故发生后，相关责任单位或受害人可以向公安机关报案，通知公安机关进行立案调查。
2. 立案调查：公安机关收到报案后，将立即展开调查，并依法调查取证，收集相关证据。
3. 展开侦查：公安机关可以采取拘留、逮捕等强制措施对犯罪嫌疑人进行侦查，并深入调查相关事实和责任人。
4. 提起公诉：如果经过侦查取证证实犯罪事实，公安机关将移交该案给检察机关，检察机关审查核实后，可以向人民法院提起公诉。
5. 审判判决：人民法院接到公诉后，依法开庭审理。如果被告人被判定犯有刑事犯罪，法院将依法进行判决，判处相应的刑罚。
需要注意的是，具体的追究刑事责任流程可能因地区、法律等因素有所不同，上述步骤仅供参考。
同时，刑事责任的追究与民事责任并不冲突，相关受害人也可以在刑事案件处理过程中或之后，通过民事诉讼途径追究相关责任单位的民事赔偿责任。