纳税人发现多缴税款的，应向税务机关提交退税申请报告、税务登记证副本、领取并填写《退税申请表》。若符合免予申报条件的，则无需补税。
个税代扣手续费要缴增值税吗
一般企事业代扣代缴个税取得的手续费不应该征收营业税。企业为员工代扣代缴个税取得的手续费不应该交营业税，与银行代储户交利息个税的性质不同
相关文件：
国税发（2001）31号关于代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税手续费收入征免税问题的通知
近据各地税务部门反映，部分储蓄机构要求明确代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税（以下简称利息税）取得手续费收入的征免税政策。为完善税收政策，进一步加强对利息征税的管理，现将代扣代缴利息税手续费收入的征免税政策明确如下：
一、根据《国务院对储蓄存款利息所得征收个人所得税的实施办法》的规定，储蓄机构代扣代缴利息税，可按所扣税款的2%取得手续费。对储蓄机构取得的手续费收入，可按所扣税款的2%取得手续费。对储蓄机构取得的手续费收入，应分别按照《中华人民共和国营业税暂行条例》和《中华人民共和国企业所得税暂行条例》的有关规定征收营业税和企业所得税。
二、储蓄机构内从事代扣代缴工作的办税人员取得的扣缴利息税手续费所得免征个人所得税。
重庆市地方税务局关于金融企业取得的代扣代缴个人所得税手续费收入缴纳营业税有关问题的通知渝地税发[2005]198号2005-7-4
各区县（自治县、市）地方税务局，市局各直属单位：
根据《财政部关于金融企业财务处理有关问题的通知》（财金[2004]122号）要求和营业税法规的有关规定，就金融企业取得的代扣代缴个人所得税手续费收入缴纳营业税的有关问题通知如下：
一、各商业银行、城市信用合作社、农村信用合作社、邮政储蓄机构以及证券公司取得的由税务部门支付的代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税的手续费，应计入“营业收入—手续费收入”，并按规定缴纳营业税。
二、2005年以前取得的代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税的手续费未列入营业收入核算并有节余的，应将节余部分全部计入“营业收入—手续费收入”，并就节余部分的手续费收入申报缴纳营业税。
三、对金融企业取得的由税务部门支付的代扣代缴工资薪金个人所得税手续费收入，暂不征收营业税。
广西壮族自治区地方税务局关于企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入纳税问题的函
桂地税函[2009]446号
2009年8月14日
广西瑞林税务师事务所有限责任公司：
你公司《关于企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入问题的请示函》（桂瑞函字[2009]042号）收悉。经研究，现对企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入纳税问题函复如下：
一、根据《中华人民共和国营业税暂行条例》和《国家税务总局关于代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税手续费收入征免税问题的通知》（国税发[2001]31号）的有关规定，企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入应缴纳营业税。
二、根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》的有关规定，企业代扣代缴个人所得税取得手续费收入应缴纳企业所得税。
退税怎么申请？
纳税人发现多缴税款的，应向税务机关提交退税申请报告、税务登记证副本、领取并填写《退税申请表》。税务机关检查发现的，纳税人应提交退税申请报告、税务登记证副本、稽查局的税务处理决定书或管理科、税务所出具的多交税款调查报告、领取并填写《退税申请表》，税务机关审核后，报县或市局局长批准，开具《收入退还书》，按退税程序办理退库手续。
退税详细申请步骤如下：
1、下载个人所得税 APP，打开APP后，可从以下入口进入年度汇算：首页常用业务—综合所得年度汇算。
2、首页我要办税—“税费申报”综合所得年度汇算。
3、进入申报界面后，填报方式有使用已申报数据填写和自行填写两种选择。
4、为了方便申报，推荐大家选择使用已申报数据填写，税务机关已按一定规则预填了部分申报数据，大家只需确认即可。
5、选择使用已申报数据填写—开始申报后，系统提示标准申报须知（使用已申报数据），点击“我已阅读并知晓”，开始年度汇算申报。
6、此处需要对个人基础信息、汇缴地、已缴税额进行确认。
7、确认预填的收入和扣除信息无误，可直接点击下一步。
8、数据系统将自动计算您本年度综合所得应补（退）税额。
9、确认结果后，点击提交申报即可。
如存在多预缴税款，可选择申请退税。点击申请退税后，纳税人需选择退税银行卡。如前期已添加过银行卡，系统将自动带出已填银行卡信息。您需新增，点击添加银行卡信息—确定。
如存在少预缴税款，则需要补税。如您综合所得年度汇算需要补税且不满足免予汇算条件，则需点击立即缴税， 选择相应的缴税方式完成支付即可。
若符合免予申报条件的，则无需补税。如您综合所得年度汇算需要补税但满足免予汇算条件，则在税款计算后，申报界面直接点击享受免申报即可，无需缴纳税款。