法院进行案件审理、听证、调查等程序，最终判决被告人是否有罪以及刑罚。以上是一般刑事工程重大安全事故案件的立案追诉程序，具体的操作和程序还需结合当地法律法规进行。
刑事工程重大安全事故的立案和追诉程序主要包括以下步骤：
1. 报案：当发生刑事工程重大安全事故时，相关单位或个人应该立即向公安机关报案，将事故情况进行报备。
2. 事故调查：公安机关会组织对事故进行调查，收集相关证据和询问相关人员，了解事故发生的原因和责任。
3. 侦查：公安机关在事故调查的基础上，进行进一步的侦查工作，例如收集证据材料，进行勘验、取证等工作，侦查犯罪嫌疑人的身份和行为。
4. 立案：经过事故调查和侦查工作，如果发现有作为犯罪嫌疑人的，公安机关会根据相关法律程序，将案件立为刑事案件，即正式立案。
5. 审查起诉：公安机关将侦查工作结果移交给检察机关，检察机关对案件进行审查，如果认为有足够证据支持起诉，会对犯罪嫌疑人提起公诉。
6. 审判：经过检察机关的起诉，案件进入法院审理阶段。法院进行案件审理、听证、调查等程序，最终判决被告人是否有罪以及刑罚。
以上是一般刑事工程重大安全事故案件的立案追诉程序，具体的操作和程序还需结合当地法律法规进行。