开票系统可以是手动开票或者电子开票，具体操作可根据当地税务局要求进行。报税可以选择按月或按季度进行，具体根据企业规模和当地税务局要求而定。
申请增值税发票和有效管理涉及以下步骤：
1. 注册纳税人：首先，需要按照相关法规和程序完成增值税纳税人的注册，获得纳税人识别号（税号）。这可能需要向当地税务局提交一系列必要的申请材料和文件。
2. 确定并了解税种和税率：根据企业的经营模式和所处行业的特性，需确定适用的税种和税率，如一般纳税人应纳增值税按照17%的税率计征。
3. 登记开票系统：纳税人需要在当地税务局登记开票系统，获得开票资格和相应的增值税发票种类。开票系统可以是手动开票或者电子开票，具体操作可根据当地税务局要求进行。
4. 发票开具：根据销售、服务等交易行为，按照相关法规和规定，开具增值税发票。发票包括必要的信息，如发票代码、发票号码、销售方和购买方的纳税人识别号等。
5. 发票管理和归档：建立有效的发票管理和归档制度，保证发票的安全和准确性。发票应及时录入财务系统中，并与销售、采购、库存等流水账簿进行对应和核对。
6. 发票报备和申报：按照相关法规和规定定期报送增值税申报表，将发票信息报备给税务局。报税可以选择按月或按季度进行，具体根据企业规模和当地税务局要求而定。
7. 定期复核：定期对发票进行复核和核对，确保发票的真实性和准确性。可通过财务内部审计、对账等方式进行。
8. 遵守税法规定：企业要遵守当地税法的规定，按时缴纳增值税，并配合税务机关的检查和稽查工作。
以上是一般的申请增值税发票和有效管理的步骤，具体操作应根据当地税务局的具体要求和相关法规进行。如果有具体问题和疑问，建议咨询当地税务机关或专业会计师事务所。