根据我国法律规定，土地使用权属于农村集体经济组织，一般由村委会、乡镇政府等代表农村集体经济组织行使。企业在使用农村集体经济组织的土地时，需要与村委会等农村集体经济组织签订《土地租赁协议书》，明确双方的权利义务、用途、租金等相关事项，以确保土地的合法使用和双方的合法权益。
企业可以与村委会签订《土地租赁协议书》。根据我国法律规定，土地使用权属于农村集体经济组织，一般由村委会、乡镇政府等代表农村集体经济组织行使。企业在使用农村集体经济组织的土地时，需要与村委会等农村集体经济组织签订《土地租赁协议书》，明确双方的权利义务、用途、租金等相关事项，以确保土地的合法使用和双方的合法权益。