这需要深入分析事故的原因与后果之间的关联，确定犯罪嫌疑人的过失是否直接导致了事故的发生，这一判断往往需要依靠专业知识和复杂的因果关系推理。然而，不同的鉴定意见往往存在差异，导致案件评判结果争议，增加了判定难度。
工程重大安全事故罪的判定难点包括以下几个方面：
1. 客观事实的难以确定：工程重大安全事故往往涉及多方面的原因和环节，原因复杂，可能包括设计、施工、管理等多个环节的失误或违规行为。确定客观事实需要对大量的证据进行收集、分析和评估，难以全面而准确地了解事故的全貌。
2. 专业知识的要求：工程重大安全事故通常需要依靠相关专业知识进行鉴定，并根据专业标准来判断责任。但法官、检察官等司法人员可能没有足够的专业知识和经验，难以准确判断专业鉴定结果的合理性和可靠性。
3. 直接责任和间接责任的区分：工程重大安全事故责任链条往往很长，涉及多个责任主体。要准确判定各个责任主体的责任大小和程度，需要综合考虑其在事故发生中的直接作用和间接影响，难以准确把握每个责任主体的实际责任边界。
4. 条件与结果的关联：工程重大安全事故罪需要证明犯罪嫌疑人的过失行为与事故的发生结果之间存在因果关系。这需要深入分析事故的原因与后果之间的关联，确定犯罪嫌疑人的过失是否直接导致了事故的发生，这一判断往往需要依靠专业知识和复杂的因果关系推理。
5. 鉴定意见的争议：工程重大安全事故案件往往需要进行鉴定，如事故原因鉴定、责任划分鉴定等。然而，不同的鉴定意见往往存在差异，导致案件评判结果争议，增加了判定难度。