企业可以根据自身的需求和实际情况来选择合适的知识产权保护方式。
专利和商业秘密是两种不同的知识产权保护方式，可以通过以下几个方面进行区分：
1. 权利保护方式：专利是一种通过法律手段保护发明者的权益的专有权利，需要向相关机构申请并获得批准，才能获得专利权；而商业秘密是一种依靠保密措施来保护知识产权的一种方式，并不需要向任何机构申请。
2. 可保护内容：专利主要保护技术方面的新发明、新设计和新的实用工艺；而商业秘密则更广泛，可以包括任何具有商业价值的秘密信息，包括商业计划、客户信息、生产工艺、销售渠道等。
3. 保护期限：专利的保护期限通常为20年，之后相关技术就会成为公共领域的知识；商业秘密的保护期限则没有固定的时间限制，只要保持秘密性，就可以一直保护下去。
4. 对外公开：专利是通过向相关机构申请并公开发明的技术，来换取专利权的保护；而商业秘密则是通过保持秘密性来保护，在没有签署保密协议的情况下，未经许可不能对外披露。
需要注意的是，专利和商业秘密并不是互斥的，同一个技术可以既可以通过申请专利的方式来保护，也可以通过保持商业秘密来保护。企业可以根据自身的需求和实际情况来选择合适的知识产权保护方式。